En el año 2006 se inició el compromiso de integración de valores ambientales en la estructura del Consorci de la Zona Franca. En este sentido se ha construido un sistema de gestión ambiental para las actividades que se llevan a cabo en el edificio de oficinas, el parque móvil de vehículos y las zonas comunes del Polígono de la Zona Franca.

El sistema de gestión ambiental del Consorci se ha desarrollado a partir de los requerimientos especificados en el reglamento EMAS y la norma UNE-EN ISO 14001: 2004: Sistemas de gestión ambiental. Fruto de este trabajo se ha obtenido la ISO-14.001 en el año 2007 y el certificado EMAS en 2008.